En 1962 revoluciona el mercado con la primera pelota de fútbol de 32 paneles de cuero cosidos a mano, configuración estándar en las décadas consecutivas. En 2011 comenzó con una grata sorpresa para sus hinchas, siendo líder del torneo durante las primeras fechas a pesar de contar con un reducido presupuesto y con prácticamente los mismos jugadores del año anterior a excepción de la contratación de jóvenes valores caso de Juan Araujo y el ascenso al primer equipo de Diego Virrueta y Luis Romero. El club participó pues en dicho torneo -conocido popularmente como la Copa de la Coronación-, el cual les dio su primer título en el mismo año de su fundación: la Copa de la Gran Peña, como trofeo consolación de prolongación del concurso. Sin embargo, en la segunda rueda del campeonato hubo una pelea interna entre el técnico Marcelo Trobbiani y Julio García, camiseta futbol por lo que Trobbiani dejó el club y se nombró como nuevo entrenador a Carlos Daniel Jurado. Y Como Un Justo Premio, LLegó el Gol, Con Alegría, Llanto y Emoción. En Cusco lo Despedimos con Un Buen Gol, Y Nos Clasificamos a la Final.
Y tus Cuatro Delanteros, Orgullo de Nuestro Cusco. Ayayayay, Orgullo de Nuestro Cusco. En 2019, Cienciano del Cusco campeonó la Liga 2 logrando ascender a la Primera División tras vencer 4-2 a Santos, quedando primero con 44 puntos en el torneo. En 2009 decayó su rendimiento, terminando a mitad de tabla del Descentralizado 2009 y sin posibilidad de participar en algún torneo internacional. Ronaldinho fue convocado en varios amistosos durante aquel año, pero no fue convocado para la Copa Confederaciones 2013, a pesar del buen nivel de Ronaldinho en el Atlético Mineiro. Campeón en diversas ocasiones de las más importantes competiciones de aquel continente, llegó a ser subcampeón en 2013 de la Copa Mundial de Clubes de la FIFA 2013, tras perder la final que lo enfrentó al Bayer Munich de Pep Guardiola, precisamente en Marruecos, en el estadio de Marrakech. Una importante muestra de cultura se dio durante la Copa Mundial de Fútbol de 2006 disputada en Alemania. Copa Libertadores Participó, La Sudamericana se Consagró. Por tanto, los cuatro semifinalistas, que se clasificaron para la Copa del Rey, se conocieron antes de la primera eliminatoria (18 de diciembre). Adelante, adelante Equipo del Cienciano. Adelante, adelante Equipo del Cienciano, ¡
Otra Canción Icónica del Club Cienciano, Interpretada por El Grupo DO-RE-MI, Edy Cuellar. Bajo el lema «camina o revienta», muy utilizado por el Presidente en esas fechas, el Club sale adelante y sobre esa base se articuló el «milagro del Deportivo». La magnitud que iba adquiriendo el club se fue haciendo cada vez más notable, y así se llegó al 29 de junio de 1920, cuando se produjo uno de los hechos más destacados en la historia blanca como fue la recepción de una breve misiva procedente del rey de España Alfonso XIII de Borbón al presidente del club. Por todo ello y vistos los precedentes que afectaban a las relaciones entre clubes guipuzcoanos y vizcaínos, la Federación Española decidió dividir la Federación Norte en dos federaciones separadas, la Guipuzcoana y Vizcaína declarando campeón de las mismas a Real Unión y Athletic Club respectivamente. “Di Stefano’s feats fathered faith in Real Madrid around the world, a faith that endures in places where the liturgy is not exactly Spanish nor Argentinian.
No fue hasta el año 1938 en que el diseñador y publicista Santiago Guillén Covarrubias recibió el encargo de crear un símbolo para el Colegio Nacional de Ciencias y Artes, entregando tres meses después la doble «C» sobre un fondo azul marino. El himno de Cienciano es poco conocido y difundido, al ser el mismo de su alma mater; es decir, el Colegio Nacional de Ciencias. En 2015 sería un pésimo año para Cienciano, ya que además de haber descendido a la Segunda División, camisetas de fútbol su eterno rival (Melgar) se consagraría campeón nacional en el año de su centenario. Luego de haber descendido, en la Segunda División 2016, Cienciano terminaría en el 3.er lugar, peleando hasta la última fecha por el ascenso a Primera División. El equipo que finalice en el 10.º puesto es relegado a la División Uno, mientras que los equipos que finalicen en el 8.º y el 9.º puesto juegan un campeonato de 4 equipos ante los equipos que terminen 2.º y 3.º en la División Uno. Llodio abandona la Federación Vizcaína y se inscribe en la Federación Alavesa, considerando que al tener menor nivel esta competición, será más sencillo lograr el ascenso a Tercera división.