Se adoptó el escudo de la Federación Croata de Fútbol para la camiseta, y seguiría junto a la camiseta, presente hasta la actualidad. El Baleares FC participó en el Campeonato Regional de Baleares oficial, organizado inicialmente desde 1923 por la Federación Catalana de Fútbol y desde 1926 por la Federación Balear de Fútbol, hasta su supresión en 1940. El club siempre estuvo en primera línea de la competición: fue subcampeón hasta en 9 ocasiones del Campeonato de Mallorca, solamente superado por la RS Alfonso XIII FC (después RCD Mallorca) o por el CD Constancia de Inca. En otras competiciones destacó su triunfo en la Copa Presidente de la República, torneo disputado por los equipos de primera categoría del campeonato mallorquín durante las temporadas 1933-34, 1934-35 y 1935-36, con un trofeo en disputa concedido por el entonces presidente Niceto Alcalá Zamora. En el Torneo Apertura 2014 durante el transcurso del campeonato se disputarían el torneo con el Tucanes de Amazonas, Deportivo Táchira y Trujillanos Fútbol Club. Pere Serra Cladera, hasta entonces presidente del Baleares FC, fue investido como primer mandatario de la nueva entidad. La primera temporada del Atlético Baleares como tal fue la 1942-43 en Primera Regional.
El Cádiz bajo las órdenes del uruguayo Víctor Espárrago consigue en la temporada 2004-05 el ascenso a Primera División, el cual se consuma en Chapín, ante el Xerez CD, al cual vencen los amarillos por 0-2, con tantos de Oli y Abraham Paz de penalti. Ambos equipos ascendieron a la Tercera División, categoría entonces desaparecida pero recuperada para la temporada siguiente. Partiría desde la Segunda Regional, categoría más baja del fútbol asturiano, presentándose con fichajes como Fran Álvarez, exjugador de Real Madrid Castilla y Rodri, del Playas De Jandia de Fuerteventura y en esa presentación el presidente se comprometió a subir el equipo año a año hasta la tercera división, categoría en la que milita el Unión Popular, promesa que repetiría más adelante. Entonces los resultados deportivos del club se resentían y ocupaba posiciones bajas que amenazaron con el descenso a Segunda Regional; pero sin llegar a consumarse. El cual consigue que Gimnasia llegue a la final de la Copa Argentina 2017-18. Tras perder la final y los malos resultados en la liga, es despedido y Darío Ortiz, exjugador del Club campeón de la Copa Centenario de la AFA, sería su reemplazante. Se destacó mucho el hecho de que se cerraran universidades, se desmantelaran museos y colecciones científicas (muy afectados por la Guerra de la Independencia Española) y se abriera la Escuela de Tauromaquia de Sevilla confiada a Pedro Romero, que había inaugurado en 1785 la Plaza de toros de Ronda (donde sigue celebrándose cada año una corrida goyesca).
El club estuvo a punto de participar en la Olimpiada Popular de Barcelona que iba a celebrarse del 19 al 26 de julio de 1936; el alzamiento militar hizo que sus jugadores se encontrasen casualmente en la zona republicana al iniciarse la guerra civil española. El Ayuntamiento de Palma aprobó en 1942 un plan urbanístico que obligaba a otro club de la ciudad, el Club Deportivo Atlético (hasta 1941 llamado Athletic Foot-ball Club), a abandonar su campo (sa Punta). El terreno de juego fue el que hasta entonces había utilizado el Mallorca, sa Síquia Reial. En 1921 el Baleares FC disputó su primer torneo importante: la Copa Ayuntamiento de Palma, quedando segundo en un torneo que ganó la Real Sociedad Alfonso XIII (actual Real Mallorca). El primer presidente fue Bartomeu Llabrés Albertí (1886-1951), camiseta futbol baratas vinculado hasta entonces al Mallorca. Desde el 2011 hasta el 2015, el club que ocupaba el último lugar del año anterior era desprogramado por una temporada.
En 1940 cambió su nombre Baleares Foot-Ball Club por Club de Fútbol Baleares, obligado por las directrices del régimen franquista que obligaban a castellanizar toda la terminología deportiva. 1920 (según las fuentes) se celebró una asamblea fundacional que aprobó la fusión de Mecánico y Mallorca con el nombre de Baleares Foot-ball Club, nombre aceptado por unanimidad por los asistentes al considerarlo más regional y representativo. La rectora nacional le solicitaba a la liga profesional sus participaciones en dinero por los torneos y las transacciones que realizaba. Dado que, tras la suspensión de la final de la Copa del Rey 2019-20 a causa de la pandemia por COVID-19, los finalistas Real Sociedad y Athletic Club acordaron jugarla en fecha por determinar dentro de la temporada 2020-21 y con público en las gradas, lo que implica exceder la fecha límite impuesta por la UEFA para la disputa de las finales de Copa de sus asociaciones miembro, la plaza de Liga Europea correspondiente al campeón de Copa, será otorgada al séptimo clasificado de Liga. La nueva categoría supuso que los equipos baleares tuviesen que jugar contra equipos de la península (catalanes o valencianos, o ambos a la vez).