Desde el principio de la Regionalliga en 1994, el equipo jugó en la Regionalliga Süd, después de jugar en la Oberliga desde 1978. Actualmente el filial juega en la Regionalliga Bayern, una de las cinco ligas que componen la Regionalliga, el cuarto nivel del fútbol alemán. El Unterhaching que hace vida en las afueras, al sur de Múnich, es el tercer equipo de la ciudad. En Sevilla, se permitió que la mayoría de los jugadores de los equipos locales que estaba en la zona franquista dispusieran de destinos en la ciudad y en sus inmediaciones de forma que pudieran continuar la práctica del deporte. «gran clásico alemán». Son los dos equipos por excelencia del balompié alemán, y cada partido entre sí se ven las gradas tanto del Allianz Arena como las del Signal Iduna Park llenas. Curiosamente aquel partido jugado el 1 de julio de 2000 fue la última vez que se enfrentaron ambos equipos en este recordado clásico. Véanse también: Der Klassiker, Südderby, El Clásico europeo y Derbi de Múnich. Edmund Stoiber. A pesar de la rivalidad, el Bayern ha apoyado repetidamente al 1860 Múnich en años donde este último tuvo crisis financiera. En los años 1970 y 1980, el 1860 Múnich estuvo entre la primera y la tercera división, pero últimamente se ha establecido en la segunda división.
En la temporada 1992-93 finaliza la época dorada del Cádiz en primera división. El 1 de noviembre de 1870 el periódico jerezano El progreso publicó en su sección local una noticia que es la primera referencia escrita sobre el fútbol en España. El ámbito de actuación del club no solo se limita a Alemania, ya que posee presencia en diversos países del mundo, siempre enfocándose en el desarrollo de juveniles. Antes del último partido de la temporada, camisetas de futbol replicas se inicia con la actuación de una orquesta que entona uno de los himnos de la institución: «Forever Number One». Por otra parte el poeta y escritor alemán Albert Ostermeier escribió en el Süddeutsche Zeitung: «El Bayern no pertenece a ningún jeque, y todavía tiene más alma que la mayoría de los otros clubes». A pesar de ello, el club ha fallado a menudo y más dramáticamente en fútbol que en otros deportes. En sentido figurado, el término también se utiliza en otros deportes. El palmarés unificado del primer equipo profesional de fútbol se compone de 5 competiciones de carácter nacional: Liga, Copa, Supercopa, Copa de la Liga y Copa Eva Duarte, junto con otras 4 competiciones de carácter europeo desde la creación de las primeras competiciones europeas a nivel global en 1955: Copa de Europa, Recopa de Europa, Supercopa de Europa, Copa de Ferias, una de carácter intercontinental: Copa Intercontinental y una competición de carácter mundial: Copa Mundial de Clubes de la FIFA.
La Copa Presidente Federación Española de Fútbol (1941), competición oficial organizada por la Real Federación Española de Fútbol que se jugó en formato de liguilla entre campeones de Liga y Copa y los dos mejores clasificados en Liga después del campeón. En la temporada 2017/18, en la que se estrenaba el nuevo estadio rojiblanco, albergó el 21 de abril de 2018 la final de la competición. La rivalidad se hizo muy fuerte a finales de la década de los setenta y principios de los ochenta, y en lo que al balompié se refiere, son los únicos equipos de Alemania junto con Borussia Dortmund que han conseguido ganar el mayor título europeo de fútbol: la Liga de Campeones de la UEFA, y también son los únicos dos equipos que han obtenido el doblete de liga y copa de Europa, en Alemania. La cuarta copa llegaría en 2001 después de haber caído tres veces en las finales de 1982, 1987, y 1999. En la década de 2010, el Bayern jugó tres finales (2010, 2012, y 2013), ganando la de 2013, mientras que en el 2020 conseguiría su sexto título. De acuerdo a jugadores y aficionados, las victorias finales no representan una «felicidad», sino el resultado de una fuerza proveniente del nerviosismo, la resistencia y la experiencia.
El susto de esa campaña fuerza un cambio en la dirección deportiva. A principios de 2008, los sectores opositores a la presidencia enviaron una carta al Gobernador de la Provincia de Santa Fe, Hermes Binner, denunciando una serie de irregularidades de la gestión oficial, solicitando la intervención del club, e instando al llamado a elecciones. Philipp Lahm, exfutbolista y capitán del club, dijo que jugar contra Núremberg es algo «siempre especial» y trae una «atmósfera caldeada». Ambos clubes jugaron en la misma liga en la mitad de la década de 1920, pero entre 1920-1930, el Núremberg estaba distante de poder obtener resultados exitosos. Históricamente y desde 1920, el Núremberg fue el rival principal y tradicional del Bayern, disputándose así el «Derbi bávaro». Una opción que también fue planteada en la planificación previa, era la de utilizar una máquina perforadora creada para cavar pozos petrolíferos, que ofrecía la principal ventaja de romper un ducto del diámetro definitivo, o sea de 70 cm inmediatamente; además, su poder le permitiría avanzar a mayor velocidad. Alemania. Esta rivalidad se debe en gran parte al enfrentamiento que ha habido siempre por ser la mejor región del sur de Alemania -Baviera o Baden-Wurtemberg-, aparte de la rivalidad que existe a nivel ciudadano entre Múnich y Stuttgart.